FBS frembyder en betydelig risiko ved fremstilling af lægemidler, idet produktet indeholder forskellige mængder af endotoxiner, hæmoglobin og andre uønskede eller skadelige stoffer.

Endotoxiner kan ikke blot påvirke cellernes vækst, men kan også videregive sygdomme, hvis serum bruges til produktion af vacciner f.eks. mod mæslinger, fåresyge, polio eller ved produktion af medicin mod kræft og multipel sklerose. Blandt andet derfor fraråder en række sundhedsmyndigheder i Danmark og i udlandet brugen af føtalt kalveserum. Man frygter især at kvæg med kogalskab (BSE; bovin spongiform encefalopati) kan blive anvendt ved produktionen.

The use of serum or other poorly defined reagents is not recommended in the production of new biologicals from cell culture, and wherever possible chemically defined alternatives should be sought.”
– WHO, Recommendations for the evaluation of animal cell cultures as substrates for the manufacture of biological medicinal products and for the characterization of cell banks, 2010